Най-мощният суперкомпютър се бори с коноравируса

Доброволци създадоха най-мощния суперкомпютър, отделяйки свободен капацитет на своите компютри за съвместна работа по т.нар. нагъване на протеини (protein folding) – задача, която може да се окаже решаваща за справяне с коронавируса, съобщи в. „Гардиън“. Според организацията Folding@home, която управлява дистрибутираната компютърна платформа, на 25 март нейната комбинирана изчислителна мощност е прехвърлила 1 000 000 000 000 000 000 операции в секунда – т.нар. екзафлоп.

Това я направи 6 пъти по-мощна от най-бързия суперкомпютър в момента – IBM Summit, който се използва за научни изследвания в американската Национална лаборатория Оук Ридж в щата Тенеси. Но до този понеделник капацитетът ѝ нарасна повече от 2 пъти, достигайки 2,4 екзафлопа – повече от 500-те най-мощни суперкомпюютри взети заедно, благодарение на включването на над 1 млн. нови потребители в мрежата.

Доброволците инсталират софтуер на своите компютри, който зарежда и изпълнява малки задачи, за да помогне за определнето на физическата структура на протеините. Сложните протеини са направени от една или повече вериги от аминокиселини, които са нагънати по комплексни, но изчислими начини, за да образуват 3D форми. Чрез прилагането на известните правила дори домашен компютър може да извършва изчисления за нагъване, а когато се обедянат милиони в това начинание, заедно могат да решават изключително сложни задачи.

През март Folding@Home обяви кръг от задачи, свързани с Covid-19, който накара сътрудниците да работят за симулиране на динамиката на протеините, които изграждат Sars-Cov-2, вирусът, предизвикващ заболяването с цел да се намерят подходящи медикаменти за борба с него.

Вече има резултати, които установяват механизма на проникване на вирусния протеин чрез отварянето на върховете на т.нар. шипчета на коронавируса.